MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Erwinia amylovora CFBP1430 chromosome

Total Repeats: 70266

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013961	CGG	2	6	67	72	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486493
2	NC_013961	AG	3	6	138	143	50 %	0 %	50 %	0 %	292486493
3	NC_013961	CAG	2	6	146	151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486493
4	NC_013961	GCT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486493
5	NC_013961	TGT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486493
6	NC_013961	GTGG	2	8	302	309	0 %	25 %	75 %	0 %	292486493
7	NC_013961	GTG	3	9	369	377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486493
8	NC_013961	GCT	2	6	397	402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486493
9	NC_013961	GAT	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486493
10	NC_013961	TCGA	2	8	817	824	25 %	25 %	25 %	25 %	292486494
11	NC_013961	TAA	2	6	839	844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486494
12	NC_013961	GGT	2	6	861	866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486494
13	NC_013961	CCA	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486494
14	NC_013961	CTT	2	6	884	889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486494
15	NC_013961	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486494
16	NC_013961	GCA	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486494
17	NC_013961	GAT	2	6	942	947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486494
18	NC_013961	AGC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486494
19	NC_013961	CGT	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486494
20	NC_013961	TGA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486494
21	NC_013961	CGG	2	6	1394	1399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486495
22	NC_013961	CAG	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486495
23	NC_013961	TC	3	6	1447	1452	0 %	50 %	0 %	50 %	292486495
24	NC_013961	GCC	2	6	1455	1460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
25	NC_013961	CAGC	2	8	1461	1468	25 %	0 %	25 %	50 %	292486495
26	NC_013961	GAA	2	6	1507	1512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486495
27	NC_013961	CGC	2	6	1523	1528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
28	NC_013961	GC	3	6	1800	1805	0 %	0 %	50 %	50 %	292486495
29	NC_013961	AGT	2	6	1808	1813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
30	NC_013961	ACC	2	6	1822	1827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486495
31	NC_013961	GCTG	2	8	1901	1908	0 %	25 %	50 %	25 %	292486495
32	NC_013961	TGC	2	6	2041	2046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
33	NC_013961	GAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292486495
34	NC_013961	GCC	2	6	2142	2147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
35	NC_013961	GTC	2	6	2190	2195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
36	NC_013961	GTG	2	6	2239	2244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486495
37	NC_013961	CGCC	2	8	2369	2376	0 %	0 %	25 %	75 %	292486495
38	NC_013961	CCG	2	6	2408	2413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
39	NC_013961	TCC	2	6	2437	2442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486495
40	NC_013961	GCC	2	6	2464	2469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
41	NC_013961	CTT	2	6	2513	2518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486495
42	NC_013961	CAG	2	6	2523	2528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486495
43	NC_013961	GCT	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
44	NC_013961	TGA	2	6	2556	2561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
45	NC_013961	CCAGCC	2	12	2604	2615	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	292486495
46	NC_013961	TCA	2	6	2617	2622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
47	NC_013961	CCA	2	6	2625	2630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486495
48	NC_013961	CGG	2	6	2651	2656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486495
49	NC_013961	A	6	6	2667	2672	100 %	0 %	0 %	0 %	292486495
50	NC_013961	ATC	2	6	2760	2765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
51	NC_013961	TGT	2	6	2810	2815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
52	NC_013961	CAGG	2	8	2851	2858	25 %	0 %	50 %	25 %	292486495
53	NC_013961	CTG	2	6	3003	3008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
54	NC_013961	TCG	2	6	3131	3136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
55	NC_013961	TCA	2	6	3148	3153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486495
56	NC_013961	GC	3	6	3156	3161	0 %	0 %	50 %	50 %	292486495
57	NC_013961	GCC	2	6	3171	3176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486495
58	NC_013961	TGA	2	6	3191	3196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
59	NC_013961	ATA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486495
60	NC_013961	TCG	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486495
61	NC_013961	TGT	2	6	3349	3354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
62	NC_013961	TGG	2	6	3406	3411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486495
63	NC_013961	TGT	2	6	3412	3417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486495
64	NC_013961	ATG	2	6	3426	3431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486495
65	NC_013961	GCG	2	6	3522	3527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
66	NC_013961	GCT	2	6	3629	3634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
67	NC_013961	GTTGCT	2	12	3635	3646	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	292486496
68	NC_013961	GA	3	6	3703	3708	50 %	0 %	50 %	0 %	292486496
69	NC_013961	ACC	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
70	NC_013961	AGGC	2	8	3766	3773	25 %	0 %	50 %	25 %	292486496
71	NC_013961	GCTG	2	8	3800	3807	0 %	25 %	50 %	25 %	292486496
72	NC_013961	CTGA	2	8	3822	3829	25 %	25 %	25 %	25 %	292486496
73	NC_013961	TGA	2	6	3865	3870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	292486496
74	NC_013961	AGC	2	6	3887	3892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
75	NC_013961	CAG	2	6	3918	3923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
76	NC_013961	CGTT	2	8	3949	3956	0 %	50 %	25 %	25 %	292486496
77	NC_013961	TGG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292486496
78	NC_013961	CAG	2	6	4089	4094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
79	NC_013961	CCA	2	6	4103	4108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
80	NC_013961	GCC	2	6	4109	4114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486496
81	NC_013961	CGG	2	6	4161	4166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
82	NC_013961	CAG	2	6	4167	4172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
83	NC_013961	ATC	2	6	4182	4187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486496
84	NC_013961	ATC	2	6	4266	4271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486496
85	NC_013961	CTTCG	2	10	4284	4293	0 %	40 %	20 %	40 %	292486496
86	NC_013961	CAG	2	6	4323	4328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
87	NC_013961	GGCT	2	8	4333	4340	0 %	25 %	50 %	25 %	292486496
88	NC_013961	CGCGC	2	10	4392	4401	0 %	0 %	40 %	60 %	292486496
89	NC_013961	CGC	2	6	4422	4427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486496
90	NC_013961	CAG	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
91	NC_013961	GCT	2	6	4511	4516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
92	NC_013961	AGC	2	6	4522	4527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
93	NC_013961	TGC	2	6	4591	4596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
94	NC_013961	GTT	2	6	4664	4669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486496
95	NC_013961	CAG	2	6	4683	4688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
96	NC_013961	CTG	2	6	4734	4739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486496
97	NC_013961	GCG	2	6	4766	4771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486496
98	NC_013961	TTG	2	6	4791	4796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486496
99	NC_013961	CG	3	6	4826	4831	0 %	0 %	50 %	50 %	292486496
100	NC_013961	GAGG	2	8	4845	4852	25 %	0 %	75 %	0 %	292486496
101	NC_013961	CAG	2	6	4890	4895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486496
102	NC_013961	TAA	2	6	4898	4903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292486496
103	NC_013961	CCA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292486496
104	NC_013961	CTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
105	NC_013961	TTC	2	6	5012	5017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486497
106	NC_013961	GCCA	2	8	5025	5032	25 %	0 %	25 %	50 %	292486497
107	NC_013961	ACAG	2	8	5047	5054	50 %	0 %	25 %	25 %	292486497
108	NC_013961	GCTG	2	8	5062	5069	0 %	25 %	50 %	25 %	292486497
109	NC_013961	CAGC	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	292486497
110	NC_013961	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
111	NC_013961	CTG	2	6	5141	5146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
112	NC_013961	GTC	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
113	NC_013961	CAGC	2	8	5288	5295	25 %	0 %	25 %	50 %	292486497
114	NC_013961	GTGA	2	8	5373	5380	25 %	25 %	50 %	0 %	292486497
115	NC_013961	CGG	2	6	5383	5388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
116	NC_013961	GCC	2	6	5432	5437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486497
117	NC_013961	TGC	4	12	5472	5483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
118	NC_013961	GGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
119	NC_013961	TTG	2	6	5507	5512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486497
120	NC_013961	GCT	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
121	NC_013961	AGC	2	6	5580	5585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
122	NC_013961	CAG	2	6	5621	5626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
123	NC_013961	AT	3	6	5718	5723	50 %	50 %	0 %	0 %	292486497
124	NC_013961	GCA	2	6	5755	5760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
125	NC_013961	CTG	2	6	5819	5824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
126	NC_013961	CTC	2	6	5828	5833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	292486497
127	NC_013961	GATTTT	2	12	5863	5874	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	292486497
128	NC_013961	CTG	2	6	5879	5884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486497
129	NC_013961	CAG	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
130	NC_013961	CGC	2	6	6057	6062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486497
131	NC_013961	AGC	2	6	6078	6083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292486497
132	NC_013961	GGCC	2	8	6095	6102	0 %	0 %	50 %	50 %	292486497
133	NC_013961	TCA	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486497
134	NC_013961	TCA	2	6	6241	6246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486497
135	NC_013961	CGG	2	6	6317	6322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486497
136	NC_013961	AC	3	6	6334	6339	50 %	0 %	0 %	50 %	292486497
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139	NC_013961	GCTG	2	8	6756	6763	0 %	25 %	50 %	25 %	292486498
140	NC_013961	TTTGGT	2	12	6835	6846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486498
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142	NC_013961	GC	3	6	6936	6941	0 %	0 %	50 %	50 %	292486498
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146	NC_013961	CGG	2	6	7079	7084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
147	NC_013961	CTG	2	6	7174	7179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
148	NC_013961	TGC	2	6	7235	7240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
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151	NC_013961	TCTT	2	8	7357	7364	0 %	75 %	0 %	25 %	292486498
152	NC_013961	TGT	2	6	7461	7466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	292486498
153	NC_013961	GCT	3	9	7509	7517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	292486498
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155	NC_013961	TCT	2	6	7640	7645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	292486498
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159	NC_013961	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	292486498
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242	NC_013961	ATT	2	6	12195	12200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	292486499
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250	NC_013961	GCC	2	6	12672	12677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292486499
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253	NC_013961	TTTC	2	8	12790	12797	0 %	75 %	0 %	25 %	292486499
254	NC_013961	TA	3	6	12827	12832	50 %	50 %	0 %	0 %	292486499
255	NC_013961	GT	3	6	12835	12840	0 %	50 %	50 %	0 %	292486499
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259	NC_013961	T	6	6	13236	13241	0 %	100 %	0 %	0 %	292486499
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261	NC_013961	CAT	2	6	13307	13312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292486499
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